錐体にある色素で、いまだに詳しくは解明されていない。L錐体、M錐体、S錐体の３つの錐体に対応した三種類のイオドプシンがあるとされている。このような３種類のイオドプシンの合成、分解の度合いにより、色の感覚を引き起こしているとされている。